Về vấn đề này, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

Theo nội dung Công ty cổ phần Phước Kỳ Nam phản ánh, Công ty được Ban quản lý các Khu công nghiệp Quảng Nam cấp Giấy chứng nhận đầu tư lần đầu số 33221000116 ngày 25/1/2011 để thực hiện dự án đầu tư tại Khu công nghiệp Thuận Yên. Công ty đáp ứng điều kiện doanh nghiệp thành lập mới từ dự án đầu tư trong Khu công nghiệp.

Tuy nhiên tại Thông tư số 130/2008/TT-BTC ngày 26/12/2008 của Bộ Tài chính không còn quy định về ưu đãi thuế TNDN đối với doanh nghiệp thành lập mới từ dự án đầu tư trong khu công nghiệp. Do đó Công ty không được hưởng ưu đãi thuế TNDN theo điều kiện doanh nghiệp thành lập mới từ dự án đầu tư trong Khu công nghiệp.

Căn cứ theo các quy định nêu trên, do Công ty không thuộc diện được hưởng ưu đãi thuế TNDN, do đó không thuộc diện được chuyển tiếp ưu đãi thuế TNDN theo các quy định nêu trên.

Tại khoản 9, Điều 1 Luật số 71/2014/QH13 ngày 26/11/2014 của Quốc hội sửa đổi, bổ sung khoản 3, Điều 2 Luật số 32/2013/QH13 như sau:

“Doanh nghiệp có dự án đầu tư được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp theo quy định của pháp luật thuế thu nhập doanh nghiệp tại thời điểm cấp phép hoặc cấp giấy chứng nhận đầu tư theo quy định của pháp luật vê đầu tư. Trường hợp pháp luật thuế thu nhập doanh nghiệp có thay đổi mà doanh nghiệp đáp ứng điều kiện ưu đãi thuế theo quy định của pháp luật mới được sửa đổi, bổ sung thì doanh nghiệp được quyền lựa chọn hưởng ưu đãi về thuế suất và về thời gian miễn thuế, giảm thuế theo quy định của pháp luật tại thời điểm cấp phép hoặc theo quy định của pháp luật mới được sửa đổi, bổ sung cho thời gian còn lại".

Hiện nay, Bộ Tài chính đang trình Chính phủ dự thảo Nghị định quy định chi tiết thi hành Luật số 71/2014/QH13 nêu trên và đồng thời dự thảo Thông tư hướng dẫn thi hành.

Do đó khi Chính phủ, Bộ Tài chính có các văn bản hướng dẫn thi hành Luật số 71/2014/QH13 nêu trên thì đề nghị Công ty cổ phần Phước Kỳ Nam liên hệ với cơ quan thuế quản lý trực tiếp để được hướng dẫn xác định cụ thể.